學校創(chuàng)辦于1993年，是一所鎮(zhèn)屬初級中學。是南海區(qū)首批現(xiàn)代信息技術示范學校，2003年被定為南海網絡教育基地。2005年被定為禪城區(qū)教研示范基地南莊三中從“質量＋特色”的辦學理念出發(fā)，以“設施好、校風正、學風濃、質量高”為辦學目標，堅持以管理強校、科研興校、質量立校和特色名校的辦學思路。學校自2013年，共建置了21間醍摩豆IRS智慧教室、14間電子書包教室。
學校堅持德育為首、育人為本、面向全體的原則，不斷改善辦學條件，不斷創(chuàng)新管理方法，以教育科研為龍頭，探索德育與教學的新路子，全面推進素質教育，辦學水平和辦學質量不斷提高。2004年南莊三中語文、數(shù)學、英語和參加禪城區(qū)說課比賽均獲得第一名，其中語文說課還獲得佛山市一等獎；數(shù)學說課獲得佛山市一等獎、廣東省一等獎、和全國一等獎。2005年南莊三中兩位英語教師參加廣東省教育廳教研室組織的英語錄像課和教學設計分別獲得一等獎和三等獎。
